In Silico

Membawa senyawa kimia dari suatu ide menjadi obat yang beredar di pasar merupakan proses yang membutuhkan sekitar rata-rata 800 juta US dollar menurut catatan yang disampaikan DiMasi dkk.[3] Biaya yang sangat besar tentunya, apalagi dikaitkan dengan kemampuan ekonomi negara-negara berkembang, seperti Indonesia. Strategi dan upaya yang efektif dan ekonomis diperlukan untuk membawa Indonesia juga turut diperhitungkan dalam penemuan obat.

Tawaran yang menarik akhir-akhir ini adalah pemanfaatan komputer sebagai alat bantu dalam penemuan obat. Kemampuan komputasi yang meningkat eksponensial merupakan peluang untuk mengembangkan simulasi dan kalkulasi dalam merancang obat. Komputer menawarkan metode in silico sebagai komplemen metode in vitro dan in vivo yang lazim digunakan dalam proses penemuan obat. Terminologi in silico, analog dengan in vitro dan in vivo, merujuk pada pemanfaatan komputer dalam studi penemuan obat………..selanjutnya

17 responses to “In Silico

  1. Assalamu alaikum.
    Mohon ijinnya untuk mengcopy bahan in silico sebagai referensi untuk proposal penelitian saya, kak.
    Syukran….
    =======================================
    Wa ‘alaykumussalam
    Silahkan di copy dan tlg diedit spy tidak merepotkan pembimbingnya untuk melakukan koreksi.
    Kapan2 kalau mampir lagi coba di cek pada kotak free software kemungkinan disana ada program yang berguna spt pymol, vega zz atau arguslab, silahkan saja di download.
    Semoga penelitiannya cepat kelar

  2. Terima kasih telah turut berbagi tentang pemodelan molekul.

    Salam,
    Enade

  3. berwi

    Aslm…
    Izin mengambil beberapa bahan yang berhubungan dengan in silico untuk skripsi. mudah-mudahan bermanfaat. terimakasih
    ======================================
    Semoga tugasnya cepat selesai

  4. Anna

    Asslm.wr.wb
    Pak, saya mau nanya aplikasi-aplikasi apa saja yang digunakan dalam penelitian molecular docking selain argus lab dan pymol pak? trus dimana bisa mendapatkan aplikasi tersebut untuk penelitian??
    makasi pak sebelumnya…🙂

  5. Wasslm.wr.wb
    Untuk aplikasi docking sejauh yang kami ketahui ada beberapa yaitu autodock (untuk spek Dekstop PC sekelas pentium quadcore) atau autodock vina (untuk spek Laptop dengan grafik yang tidak shareware) dan yang paling umum digunakan (akan tetapi harus dengan lisensi) yaitu MOE.
    Program MOE yang ada yaitu di Departemen Farmasi UI, dengan Bpk. Arry Yanuar atau pada Fakultas Farmasi UGM dengan Bpk B.S Arry.
    Sedikit tambahan mengenai Pymol bahwa program ini tidak dapat digunakan untuk melakukan docking akan tetapi salah satu program yang digunakan untuk visualsasi molekul berupa ligan dan reseptor target, selain itu program dgn fungsi yang sama yaitu Vega ZZ.
    Program2 diatas kecuali MOE bisa didownload [silahkan digoogling dengan kata kunci dengan nama masing2 program]
    Semoga informasi ini berguna dan penelitiannya segera berjalan.

  6. ikhsan hatam

    assalamualaikum kak
    bsa tanya…
    bagaimana cara meminta jurnal sama orang barat?
    bsa minta alamat untuk download jurnal?
    =================================================
    Wa alaykum mussalam
    Silahkan membaca beberapa komentar balasan yang terdapat pada halaman forum diskusi blog fitokimia umi, disitu sy cantumkan caranya.
    Untuk download jurnal secara gratis silahkan klik beberapa link di blog ini yang terdapat pada widget Free Article

  7. ikhsan hatam

    makasih kak

  8. Sedikit saran, bukankah sebaiknya memberi credit kepada penulisnya ketimbang hanya menyertakan alamat asalnya seperti ini?
    2. http://www.molmod.org/index. 09/03/09
    =================================
    Trims atas saranya,hal ini dibuat agar sumbernya mudah untuk ditrack back.

  9. Bahkan penulisan alamatnya pun salah jadi tidak bisa dibuka😀
    ==================================
    Sekiranya anda sedikit lebih kreatif tentu linknya akan berhasil anda akses😀
    Harap anda ingat jg bahwa web tsb diakses kurang lebih 2 thn yl dan hal ini jg dpt berpengaruh pd saat diakses sekarang.
    Trims atas apresiasinya.

  10. Hehe, iya sih, hanya saja “maaf” saya rasa kurang pantas kalau langsung copas dari situs lain tanpa menyertakan nama penulis aslinya. Kalau sekedar sitasi mungkin tidak apa-apa jika hanya menyertakan tautan.

    Sudah minta ijin ke pak Enade untuk copas artikelnya beliau belum?
    Tapi keliatannya karena beliau hanya berkomentar “Terima kasih telah turut berbagi tentang pemodelan molekul.” koq sepertinya anda belum ijin pada beliau.
    ==================================
    Sekedar info sj sy sdh ketemu langsung dgn orangnya pd saat seminar toi 39 di Bogor.
    Jd harap jgn terlalu cepat menilai.

  11. oh ya, soal alamatnya, padahal itu cuman kurang ‘.php’ lho, coba saja tambahkan ‘.php’ menjadi http://www.molmod.org/index.php
    pasti terbuka😀
    =================================
    molmod.org jg bisa🙂 btw sekali lg tx atas sarannya.

  12. Hehe, oke, maaf saya terlalu cepat menilai
    Tetap saja, saya akan merasa janggal kalau tidak ada nama penulis yang artikelnya di-copas di sana. Dan anda bahkan tidak menuliskan bahwa anda ‘menyadurnya dari artikel lain’. Pak Enade saja saat menyadur tulisannya sendiri dari chem-is-try.org menuliskan:
    “Disadur dan ditulis ulang dari tulisan di http://www.chem-is-try.org, atas seijin pemilik situs.” (http://molmod.org/2010/02/07/sekilas-tentang-pemodelan-molekul/). Ini adalah adab menyadur karangan orang lain, maaf bukan maksud saya menggurui, hanya saja saya memang paranoid kalau sudah menyangkut lisensi dan hak cipta😀. Di lain sisi, beliau adalah orang yang sangat saya hormati dan sangat berjasa bagi saya🙂

    omong-omong, POKJANAS TOI 39 di Jakarta, POKJANAS TOI 40 di Bogor🙂
    yang manapun itu, anda sudah menulis artikel ini sebelum anda bertemu pak Enade🙂
    ==================================
    Iyya maksud sy 40, harapan sy smg sj ybs tdk keberatan.
    Trims atas semua commentnya bd

  13. yup sama2, dan saya tidak tahu keberatan apa nggak, satu hal yang pasti beliau punya semangat berbagi yang tinggi😀
    ==================================
    Yup makanya klop dgn tujuan penulisan artikel ini n penulisan referensi yg anda persoalkan harapan sy smg pembaca artikel ini bisa melakukan metode pengutipan spt yg anda maksudkan.

  14. Sekedar informasi, kita juga bisa melakukan docking dengan autodock dengan antarmuka dari Pymol asalkan Plugin Autodocknya sudah terpasang. Silakan lihat http://www.pymolwiki.org/index.php/Autodock_plugin
    =================================
    Terima kasih atas informasinya Pa’ kami akan mencoba untuk melakukannya.

  15. Nur Syamsi Dhuha

    ada gak pak workshop untuk docking yang akan diadakan?
    =================================================
    Belum ada rencana, tp kl sekedar berbagi bisa qta bicang2

  16. Ahmad Marzuki

    Assalamualaikum.wr.wbr. kak untuk referensi ttg MODIFIKASI STRUKTUR 1-BENZOIL-1,3-DIMETIL UREA (docking untuk pengembangan obat anti kanker) kira-kira dmn y bsa sy dptkan? terimakasih sblmnya kak..
    Ahmad M.
    =============================
    Wa alaykum mussalam
    Silahkan masukkan kata kuncinya di google scholar.
    Nanti sy bantu nyari juga.

  17. Ahmad Marzuki

    iya kak.. terimakasih banyak sblmnya kak.
    ============================================
    Ada baiknya harus diketahui dulu target protein yang akan didocking dengan senyawanya adalah protein apa? lebih baik lagi kalau sudah ada kode pdbnya.

Tinggalkan Balasan

Isikan data di bawah atau klik salah satu ikon untuk log in:

Logo WordPress.com

You are commenting using your WordPress.com account. Logout / Ubah )

Gambar Twitter

You are commenting using your Twitter account. Logout / Ubah )

Foto Facebook

You are commenting using your Facebook account. Logout / Ubah )

Foto Google+

You are commenting using your Google+ account. Logout / Ubah )

Connecting to %s